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#CoronavirusUpdate 2021/6/1🇫🇷仏AFPが新型コロナ変異株のファクトファイルを公開。これまでの変異株をWHO指定の呼称「アルファ」「ベータ」「ガンマ」…で表記。興味深いことに #B16171 「カパ」についてはそこから派生した #B16172 を「デルタ」と表記。これではすぐに24字を使い果たしそうだ。
AFPはWHOが「懸念される変異株」(VOC)としてαアルファ・βベータ・γガンマ・δデルタ型とした4株のうち最初の3つと4つ目の「デルタ」を明確に区別。 α型 #B117 β型 #B1351 γ型 #P1 ら3変異株はいずれも #N501Y レセプターに変異がある型で、β型、γ型は #E484K #K417N レセプターに変異がある型と。 Image
一方、δデルタ型 #B16172 変異株は #E484Q #L452R レセプターに変異がみられる型であり、なぜかκカッパ型が #B16171 を指すようだが、このインフォグラフィックを正しく読めているのならば、 これら2種のレセプターに変異がみられる型が3系統存在する。

変異株の“進化“は止まることを知らない。 Image
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🧵Importante: la #variante #B1617 encontrada en #India es declarada variante de preocupación #voc por la @opsoms xke las mutaciones que porta sugieren que es más transmisible pero no hay datos sobre diagnósticos o eficiencia de #vacunas en este marco. Ahora, ¿qué es B1617?
La #variante #B1617 se le llama doble mutante xke porta 2 #mutaciones en la proteína espícula #E484Q y #L452R Estas 2 mutaciones están asociadas con más transmisibilidad dl #virus pero siempre se habían visto separadamente en distintas variantes. En B1617 se detectaron juntas
Fue detectada el pasado 5 de Octubre de 2020 en estado de Maharashtra en un 15 a 20% de casos y hoy ya forma el 60% aprox de casos en gran parte dl país. Además ha sido detectada en 21+ países. Su detección está asociada a las capacidades de #vigilanciagenomica del país!!
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Convergent evolution of #SARS_CoV_2 spike mutations, #L452R, #E484Q and #P681R, in the second wave of #COVID_19 in Maharashtra, #India | bioRxiv
#VUI biorxiv.org/content/10.110…
„newly identified lineage B.1.617 possessing common signature mutations D111D, G142D, L452R, E484Q, D614G and P681R, in the spike protein including within the receptor binding domain (RBD)“
„The structural analysis of RBD mutations L452R and E484Q along with P681R in the furin cleavage site, may possibly result in increased ACE2 binding and rate of S1-S2 cleavage resulting in better transmissibility.“
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