À un rythme d’à peu près 2 mutations par mois, le coronavirus continue sa petite évolution tranquillou (rassurez-vous, une très grande partie de ces mutations n’a aucun effet sur la dangerosité du virus ! Mais elles nous permettent quand même de faire de la science dessus) 1/6 
Par exemple en France, une grosse partie des virus reçus (et séquencés) nous sont arrivés par l’Angleterre. Le reste directement de Chine.
(pour ceux qui ont oublié les cours de SVT du lycée, on obtient ces arbres et ces cartes en comparant les séquences de nucléotides des virus. Comme pour des phrases où on retrouverait les mêmes fautes d’orthographe, on en déduit des liens de parenté)
Pour l’Islande, c’est plus marqué : beaucoup de virus reçus d’Europe, mais aussi un gros paquet reçu des États-Unis, de l’état de Washington et du Minnesota plus précisément. Quelle précision !
L’état de Washington a moins de diversité : une grosse partie des virus séquencés remonte à une introduction unique du virus vers la fin janvier.
Et tout ça en accès libre pour tous les chercheurs et curieux du monde entier. Merci l’open science ! nextstrain.org/ncov?f_country…
Tiens puisque vous êtes là ! Regardez un peu où se trouve "le coronavirus" (on devrait dire Sars-Cov-2) dans l’arbre des virus. Une vraie fractale de virus ! Et encore on est loin de tous les connaître !
Puisque vous êtes tjs là. Je réponds à quelques questions. Oui les codes couleurs correspondent à des régions. Et oui on peut remonter par ces méthodes à l’origine du virus... la Chine ! Ici l’arbre mondial, en violet la Chine, vert/jaune l’Europe, rouge les USA, bleu l’Australie
Voilà la carte des déplacements du virus. Qui veut superposer ça à la carte des liaisons aériennes ?
Et voilà une petite animation du schmilblick.
Pour ceux qui veulent aller plus loin, ce super article en français qui s’attarde sur les séquences françaises.
Attention niveau avancé !
Par l’équipe de modélisation Évolution Théorique et Expérimentale de Montpellier alizon.ouvaton.org/Rapport4_Phylo…
Attention niveau avancé !
Par l’équipe de modélisation Évolution Théorique et Expérimentale de Montpellier alizon.ouvaton.org/Rapport4_Phylo…
Et si vous cherchez des vrais experts (anglophones), j’ai compilé une liste de 50 épidémiologistes/modélisateurs / virologues que vous pouvez suivre et qui ont des choses intéressantes à dire sur l’épidémie (je peux ajouter des noms si vous me les envoyez) twitter.com/i/lists/124098…
